Espace candidat : Détails de l'offre n° S045457

Poste et missions :

• Dates du stage : A compter de janvier ou février 2027 
  Durée: 6 mois 
  
  
  Missions du poste : 
  
  Le stage s’inscrit dans le projet GENi. Le projet GENi est un projet collaboratif à l’initiative de la région Normandie alliant les expertises de l’institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) ; l’institut français du cheval et de l’équitation (IFCE) ; LABÉO, pôle d’analyses et de recherche interdépartemental de Normandie et le Campus équin normand de l'École nationale vétérinaire d'Alfort (EnvA). 
  Ce projet a pour objectif de développer des outils innovants permettant d’évaluer, dès la naissance d’un poulain, ses aptitudes naturelles pour la course — un ensemble de capacités variées et complexes — ainsi que ses prédispositions aux principales pathologies affectant les performances (troubles respiratoires, myosites, affections vertébrales, sensibilité à la rhodococcose), dans un contexte où la filière équine doit répondre à des préoccupations légitimes concernant le bien-être et la santé des chevaux soumis à des exigences de performances élevées, ainsi qu’au manque de transparence de son marché. 
  Des évaluations génétiques et génomiques précoces, outils précieux qui permettent d’identifier avec précision les qualités et les faiblesses des chevaux dès leur naissance, seront développées pour les trois grands segments de la filière équine : les courses de galop, les courses de trot et la compétition équestre. Ces évaluations offrent un double bénéfice : elles fournissent des critères objectifs qui permettent aux amateurs extérieurs d’accéder à un marché plus sûr, et elles favorisent l’adéquation entre l’élevage, l’entraînement et l’environnement des chevaux en fonction de leurs forces et faiblesses, contribuant ainsi à préserver leur santé et à assurer leur bien-être. 
  Actuellement, un indice unique existe pour les courses de trot et pour chaque discipline des compétitions équestres, ce qui ne permet pas de répondre pleinement à ces objectifs. Le projet GENi vise à aller dans le détail de toutes ces aptitudes et de la génétique en intégrant la génomique en plus du pedigree, en utilisant la puce SNP 60k développée par des chercheurs de l’INRAE et l’IFCE. Les marqueurs génomiques identifiés seront mis en miroir avec le détail des résultats en course d’une part et avec les pathologies mentionnées ci-dessus d’autre part. Le résultat sera à terme des évaluations génomiques (et plus seulement génétiques, avec le seul pedigree) diversifiées selon l’âge, le mode de course, intégrant la longévité ou la régularité. 
  Le sujet du stage portera sur l’analyse génétique des performances en course de trot. Le/la stagiaire sera chargé(e) de mener l’analyse des données de performance fournies par la Société d’Encouragement à l’élevage du Trotteur Français (SETF), de développer des modèles génétiques permettant d’estimer les paramètres génétiques (héritabilité, corrélations génétiques) des performances en courses de trot, en capturant la complexité et la diversité des carrières. 
  À ce jour, le trot ne peut s’appuyer que sur un seul indice génétique : le BTR (Blup TRotteur), calculé annuellement à partir du rapport entre les gains accumulés et le nombre de départs. Cependant, cet indice présente des limites majeures. Parce qu’il est unique il n’intègre pas : l’évolution des performances avec l’âge (précocité ou maturité tardive), la répartition des gains selon les disciplines (monté ou attelé), la longévité sportive du cheval, les stratégies d’exploitation (choix des courses, gestion de la carrière). Il ne permet donc pas de refléter fidèlement les compétences innées de chaque individu et ne tient pas compte de la consanguinité, aspect crucial à intégrer dans les évaluations génétiques. 
  
  
  Description des activités 
  
  Activités principales : 
  - Manipulation de larges bases de données sur R, réalisation d’analyses statistiques et génétiques, estimation de paramètres génétiques (héritabilité, corrélations génétiques), à l’aide du logiciel ASRemL. 
  - Intégration des données de génomiques issues du génotypage des chevaux (puce SNP 60k). 
  
  Activités secondaires :
   - Formalisation de la présentation des évaluations pour les éleveurs. 
  - Présentation aux associations d’éleveur. 
  
  
  Diplôme en préparation: 
  
  Master II ou diplôme d’ingénieur agronome. 
  Formation recommandée : Génétique quantitative, Statistiques, Analyses de données multivariées
  
  
  Qualités requises: 
  
  Savoirs et savoirs-faire : 
  Savoir-être : Autonomie, bonne qualité de contact, rigueur 
  Savoirs-faire : Bonne connaissance des logiciels scientifiques (R), souplesse pour utiliser les logiciels variés dédiés à la génétique quantitative 
  
  Expérience appréciée : 
  Connaissance du milieu du cheval 
  
  
  Conditions particulières: 
  
  - Jours d’absences gratifiés possible 
  - Restaurant collectif 
  
  
  Composition du dossier de candidature: 
  
  CV+ Lettre de motivation Date limite de candidature : 11/11/2026 
  Si le dossier de candidature est incomplet à la date limite de candidature indiquée, la candidature ne sera pas étudiée. 
  Compte tenu des restrictions budgétaires, nous ne prendrons en compte que les candidatures d’étudiants (F/H) dont les stages sont obligatoires dans le cadre de leurs études.

Profil :

• Niveau minimum requis : Exigé
• Formation en cours : Souhaité